Лес

В дебрях интернета была найдена библиотечка для рисования деревьев и графов (а также других приблуд) на JS - JIT (http://thejit.org). JavaScript я не знаю, попробовал, не понравилось. Совсем.
Мне понадобилось данное дерево использовать с большим количеством нодов. При этом, подгружая нужные ноды через AJAX, и удаляя из HTML collapsed ноды.
Если подгрузка нодов - занятие тривиальное - достаточно написать метод request (в данном случае я использую библиотеку jQuery, а на серверной части сидит обычный Spring 3):

request: function(nodeId, level, onComplete) {

            $.ajax({
                url:controllerName,
                data:{parentNodeId: nodeId},
                dataType: 'json',
                success: function(data) {
                    $jit.json.prune(data, level);
                    if (level == 0) addNodeOnTree(data, nodeId);
                    onComplete.onComplete(nodeId, data);
                }
            });
        }

function addNodeOnTree(node, parentId) {

        node.id = parentId;
        st.addSubtree(node, 'animate', {
            hideLabels: false,
            onAfterCompute: function() {
                st.compute();
            }
        });
    }

А вот с удалением нодов - дела обстоят не так радужно. Конечно, есть метод removeSubtree, который удаляет поддерево, есть метод removeNode. Но с этим связано несколько проблем:
removeSubtree жует чрезмерно много ресурсов;
remobeNode удаляет только нод из нашего графа, но не удаляет из html. и работает как то не особо красиво.
Стоит обратить внимание на метод hide, в описании которого ясно сказано, что хрен нам, а не удаление:

hide: function(nodes, controller) {
        var viz = this.viz;
        for(var i=0; i<nodes.length; i++) {
            // TODO nodes are requested on demand, but not
            // deleted when hidden. Would that be a good feature?
            // Currently that feature is buggy, so I'll turn it off
            // Actually this feature is buggy because trimming should take
            // place onAfterCompute and not right after collapsing nodes.
            if (true || !controller || !controller.request) {
            ///////

*для шибко умных хочу добавить, что это true - не индийский код, а "посмотрите на реализацию, можете поменять, но это дело забаговано, все на свой страх и риск"

Помучившись с этим какое то время, я решил, что хай же с ним, и просто сделаем по клику на нод фильтр, который будет удалять скрытые ноды из графа, и их же из html. все довольно просто. Но все равно, мне это не очень нравится.

function onNodeClick(id) {
        for (var i in st.graph.nodes) {

            if (i != undefined && !st.graph.getNode(i).drawn) {

                st.graph.removeNode(i);

                var div = document.getElementById(i);
                if (div != null)
                    div.parentNode.removeChild(div)
            }
        }
    }

суть проста: чтобы не удалить по неосторожности другие элементы страницы, мы отсеиваем только скрытые (не html display none, а которые collapsed в дереве) !st.graph.getNode(i).drawn ноды, удаляем их из дерева
st.graph.removeNode(i);
и из html
div.parentNode.removeChild(div).

Стоит обратить внимание на то, что если дерево вылазит за границы экрана, то в html эти ноды показываются как display none, а дерево их видит как st.graph.getNode(i).drawn == true

Вот такие первые впечатления. Само дерево настраивается под ваши нужды, достаточно открыть документацию.